La collection Chifflet rassemble des manuscrits sur papier des XVIe, XVIIe et XVIIIe siècles reliés en volumes au XVIIIe siècle. Ce sont des études et des documents originaux sur l'histoire de la Franche-Comté, rassemblés en particulier par Jean-Jacques Chifflet (1588-1660), qui publie en 1618 Vesontio, le premier livre sur l'histoire de Besançon, et sur Jules Chifflet, son fils, qui publie des Mémoires et inédits pour servir à l'histoire de la Franche-Comté.

Tables des registres de successions et d'absences de l'enregistrement de Haute-Saône, 1824-1899

Papiers divers de l'historien Auguste Castan (1844-1892), conservateur de la Bibliothèque municipale de Besançon de 1866 à 1892 : correspondance, notes et relevés de fouilles archéologiques à Besançon concernant les monuments de la ville romaine et d'autres fouilles en Franche-Comté (dans le Doubs à Mandeure et Alaise alors identifié comme Alésia par Castan).

La numérisation du fonds Granvelle porte sur des papiers d'État et de la correspondance de Nicolas Perrenot de Granvelle (1486-1550), ministre principal de Charles-Quint et de son fils le cardinal Antoine Perrenot de Granvelle (1517-1586), ministre de Charles Quint puis de Philippe II.Les documents rassemblés par les Granvelle constituent un ensemble unique de correspondance et de papiers politiques indispensables à la connaissance de l'Europe du XVIe siècle, notamment pour les chercheurs travaillant sur le Siècle d'Or de l'Espagne, les mondes ibériques, les Pays-Bas ou le Concile de Trente.La bibliothèque des Granvelle, comprenant des manuscrits et imprimés des XIIIe-XVIe siècle, sera numérisée par la suite.

Tables alphabétiques des registres matricules de la Haute-Saône, 1867-1935

Cette première partie de la collection comporte 531 cartes postales. Elles représentent pour une moitié des vues de Pontarlier et pour l’autre moitié des vues de Franche-Comté. Ces cartes ont été numérisées en recto-verso. Elles datent de la première moitié du XXe siècle.

Registres d'Etat civil et tables décennales de la Haute-Saône

Listes nominatives d'habitants des recensements de population de la Haute-Saône, 1791-1906

Le projet porte sur la numérisation d'environ 3500 documents photographiques (négatifs sur plaques de verre). Ce fonds présente les villages de Haute-Saône à la fin du XIXe –début XXe siècle.La numérisation permettra une diffusion plus large et plus complète de la collection. Parallèlement, l'informatisation de l'inventaire permettra d'intégrer ces images dans un nouveau programme de recherches documentaires, à terme accessible au public.

La collection regroupe différentes fonds iconographiques des archives départementales de Haute-Saône. On retrouve :- Plans et affiches restaurés en 2010 et 2011.- Documents iconographiques classés et inventoriés en 2010 et 2011.- Fonds Mayer, photographe éditeur de cartes postales à Belfort (conservé aux archives départementales du Territoire de Belfort). Les archives départementales de la Haute-Saône ont entrepris la duplication des documents de ce fonds concernant la Haute-Saône.

Ce fonds est constitué, pour majeure partie d'un don important survenu en 1998, de faïences produites en Haute-Saône entre le XVIIIe siècle et le début du XXe siècle (Boult, Cirey-lès-Bellevaux, Rioz et Clairefontaine).Cette numérisation complétant l'inventaire détaillé de chaque pièce contribue à la découverte de la variété et de la richesse du fonds de faïences du musée et ouvre de nouvelles opportunités de recherches documentaires sur la production de faïences en Franche-Comté.

Fonds de cartes postales de la fin du XIXe et du début du XXe siècle. Ces documents iconographiques représentant tous les aspects de la vie économique et sociale concernent en grande partie la Haute-Saône.

La numérisation porte sur les registres paroissiaux du département de la Haute-Saône.

Le programme de numérisation 1998 du service régional de l'Inventaire Général de Franche-Comté concerne trois secteurs géographiques et un édifice majeur du Haut Jura (la cathédrale de Saint-Claude), soit 1655 phototypes.Le programme de numérisation 2003 vise à numériser l’intégralité des photographies les concernant, en traitant donc celles écartées en 1998.Le premier secteur géographique est un milieu urbain : la ville de Gray (Haute-Saône). Il sera à terme illustré par plus de 2200 images numériques, dont 1928 réalisées dans le cadre du plan 2003.